La Unitat de Documentació de Fongs de l'herbari BCN comprèn uns 20.000 espècimens, majoritàriament dels Països Catalans. Pel que fa als tàxons, cal remarcar la representació que hi tenen els Gasteromicets, les Russulàcies i els Mixomicets. Com a col·lecció a part destaca la de Micromicets (fongs paràsits) de M.T. Losa.

De la majoria de fongs, només se'n conserven els esporocarps i d'altres estructures reproductores que permeten la seva identificació. Els materials recol·lectats al camp es deshidraten i es guarden en sobres de plàstic o de paper dins de capses de cartró. Les mostres es troben ordenades per grans grups (Ascomicots, Basidiomicots, Mixomicots, etc) i dins d'aquests grups per ordre alfabètic d'espècies.

El conservador d'aquesta unitat de documentació es el Dr. Jaume Llistosella, professor del Departament de Biologia Vegetal de la Universitat de Barcelona.