La secció de Reserva compta amb 2.169 manuscrits. El més antic és del segle X i els segles XV-XVIII són els més representats. Entre els manuscrits més emblemàtics de la biblioteca, podem citar els següents:

Crònica de Jaume I. 1343
Eiximenis. Llibre dels àngels. 1445
Llibre apellat Consueta. Segle XIV
Ciceró. Opera. Finals del segle XIV
Jardinet d'Orats. 1486.

 

- F. Miquel Rosell. Inventario general de manuscritos de la biblioteca de la Universidad de Barcelona. Madrid, 1958-1969. 4 v.
Comprèn la descripció dels manuscrits 1 al 2030. Queden ordenats per número correlatiu. El contingut de cada manuscrit queda descrit detalladament i al final hi ha especificacions sobre el suport, l'època, lletra, col·lació, mides, enquadernació, procedència i altres informacions pertinents.

Hi ha diversos índexs complementaris de l'inventari de Miquel Rosell:

• Índex provisional dels volums 1-3 de l'inventari de F. Miquel Rosell. 7 carpetes.
  Ordenat per matèries i autors. Remet al nº de volum i al nº de pàgina de l'inventari.
• Índex provisional del volum 4 de l'inventari de F. Miquel Rosell. 1 carpeta. Dividit en dues parts: per autors i per matèries. Remet al nº de manuscrit de l'inventari.
• Taula cronològica dels manuscrits. 1 carpeta.
• Taula de correspondència de les signatures antigues a les actuals i viceversa.
• Per als manuscrits 2031 fins al 2169 hi ha un inventari.